Le , Rice est mis sous contrat par les Mets de New York. Invité au camp d'entraînement du printemps suivant, il se fait remarquer par sa capacité à forcer les frappeurs adverses à cogner des roulants, et non des balles au champ extérieur, et complète ses 11 sorties et 12 manches et un tiers lancées avec une moyenne de points mérités de 2,92[4]. Âgé de 31 ans et 14 ans après ses débuts professionnels, Scott Rice atteint enfin les majeures lorsqu'il fait une première apparition comme lanceur de relève pour les Mets de New York le 1er avril2013. À sa première sortie, il lance une manche parfaite et retire sur des prises les deux premiers des trois frappeurs des Padres de San Diego qu'il affronte[5].
Régulièrement utilisé par les Mets en 2013, le spécialiste gaucher lance 51 manches en 73 parties et maintient une moyenne de points mérités de 3,71 avec 4 victoires et 5 défaites. Il savoure son premier gain dans les majeures sur les Marlins de Miami le [6].
Il est retranché de l'équipe et cédé aux ligues mineures en 2014 après un difficile début avec les Mets. Cette saison-là, sa moyenne de points mérités s'élève à 5,93 en 13 manches et deux tiers lancées lors de 32 matchs joués pour le club new-yorkais.