Skršín se trouve à 10 km à l'est du centre de Most, à 31 km au sud-ouest d'Ústí nad Labem et à 66 km au nord-ouest de Prague[2].
La commune est limitée par Korozluky et Lužice au nord, par Měrunice à l'est, par Kozly et Bělušice au sud, et par Bečov à l'ouest[3].
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