Virobiote

Le virobiote (ou virome humain) constitue la composante virale du microbiote. L'ensemble de ces virus présents dans la flore intestinale, et sur le derme contribueraient, parmi d'autres facteurs à la régulation (homéostasie) du microbiote et du système immunitaire^[1]. Le microbiome désigne l'« aire biotique » (aire de vie) d'un microbiote, ce dernier terme caractérisant les organismes qui prédominent ou sont durablement adaptées « à la surface et à l'intérieur » d'un organisme vivant. On devrait donc, par analogie, employer le plus souvent le terme de « virobiote », mais, par abus de langage, on parle plus couramment de virome humain (en) pour le désigner.

On^[Qui ?] estime qu'il y a dans le corps humain 100 fois plus de virus (10¹⁵) que de cellules humaines (10¹³)^[2]. Chaque être humain en bonne santé porte en moyenne plus de 10 espèces de virus responsables d'infections virales systémiques chroniques et asymptomatiques^[3].

Une étude du virobiote intestinal a dénombré 13 000 espèces de virus dont 96 % sont des bactériophages^[4],[5].

Certaines dysbioses du virobiote ont été associées à des situations pathologiques, liée à une absence ou la présence de certains bactériophages. Ainsi, par exemple :

• La présence de phages Propionibacterium et d'autres modifications sont associées à des infections respiratoires récurrentes chez les enfants^[6]
• Les infections à Clostridium difficile ont été associées à un déficit en virus caudovirales^[7]. En effet, ces derniers bactériophages empêcheraient la formation de biofilms bactériens dans l'épithélium intestinal^[8].
• Un phagéome spécifique (on composition en bactériophages du virobiote) est corrélé au diabète de type 2^[9].