De 2003 à 2007 W. Foden gère le Programme des Espèces Menacées du South African National Biodiversity Institute[6], basé à Pretoria. À ce titre, elle a joué un rôle important dans l'établissement d'atlas et les programmes d'évaluation de la conservation des plantes[7], des reptiles[8], des papillons[9] et des arachnides. Elle a créé une bourse de recherche postdoctorale sur les espèces menacées et a servi en tant que présidente du Groupe de spécialistes des plantes d'Afrique Australe de la Commission de survie des espèces de l'UICN (Species Survival Commission).
En 2007, Foden part au Royaume-Uni rejoindre le Programme des Espèces Mondiales de l'Union internationale pour la conservation de la nature[10], basé à Cambridge[11]. En collaboration avec les chercheurs de la Commission de Survie des Espèces de l'UICN, elle a développé une méthode d'évaluation de la vulnérabilité des espèces au changement climatique qui implique de modéliser une prédiction d'exposition de chaque espèce au changement climatique et en examinant les traits biologiques qui sont susceptibles de les rendre plus ou moins sensibles et capables de s'adapter à ces changements. Dans une publication de 2013, Foden et ses co-auteurs décrivent la méthode et son application à tous les oiseaux, les amphibiens et les coraux[12]. L'étude met en évidence les espèces dans ces groupes ayant le plus haut risque d'extinction liée au changement climatique, ainsi que les régions où elles sont concentrées. L'étude compare la vulnérabilité au changement climatique des espèces avec leur risque d'extinction sur la Liste rouge de l'UICN des Espèces Menacées et met en évidence les priorités à la fois les plus urgentes et les plus nouvelles en matière de conservation. Foden et son équipe ont également appliqué cette approche à des projets d'évaluation de vulnérabilité au changement climatique focalisés au niveau régional en Afrique Centrale et dans l'est du Rift Albertin[13], en Afrique de l'Ouest et à Madagascar.
Foden organise une série d'actions de sensibilisation sur les impacts du changement climatique sur la biodiversité, notamment à travers des conférences et des séminaires. En 2009, elle a dirigé un rapport et une conférence de presse orientée vers le grand public intitulés « Ten New Climate Change Flagships : More Than Just the Polar Bear (Dix nouveaux emblèmes du changement climatique : Il n'y a pas que l'ours polaire) »[14] lors de la Conférence de Copenhague de 2009 sur le climat. Elle a été maître de conférences invitée à l'Université de Cambridge pour le cours de mastère de Conservation Leadership dans les années 2010[15]. Foden a été membre du comité directeur du Groupe de Spécialistes du Changement Climatique de la Commission de Survie des Espèces de l'UICN pendant de nombreuses années[16] et est administratrice de l'Environment Africa Trust[17].
À compter de 2016, Foden préside le Groupe de Spécialistes du Changement Climatique de l'UICN quand l'équipe a créé de nouvelles lignes directrices pour la communauté de la conservation, afin d'évaluer la vulnérabilité des espèces au changement climatique. En même temps, elle est aussi chercheuse "Senior" à l'Université de Stellenbosch, en Afrique du Sud[18].
