Pendant la guerre civile anglaise, le 7e comte Marischal rejoint James Graham (1er marquis de Montrose) et s'empare à deux reprises d'Aberdeen en 1639, notamment après une marche avec Montrose et 9 000 hommes le long de la Causey Mounth, devant le château de Muchalls [2] et à travers Portlethen Moss pour attaquer via le pont de Dee.
Il est nommé Lord des articles après la pacification de Berwick-upon-Tweed, et s'empare de nouveau d'Aberdeen et fait respecter les signatures de l'alliance en 1640. En 1641, il est nommé conseiller privé.
Il assiste à des comités d'alliance dans le nord, mais reste inactif en 1643-1644. Il refuse par la suite de livrer les fugitifs à Montrose et est assiégé au château de Dunnottar en 1645. Il rejoint ensuite l'expédition d'Hamilton en Angleterre en 1648 et reçoit Charles II à Dunnottar en 1650. Il est arrêté à Alyth avec de nombreux autres nobles et généraux écossais lors d'un incident connu sous le nom de «Onfall of Alyth» [3] et emprisonné dans la Tour de Londres jusqu'à la Restauration, date à laquelle il est nommé gardien du sceau privé d'Écosse.
