Né le à Mbour, Youssou Diagne a fait sa scolarité à l'école catholique de Popenguine, puis à Diourbel avant de revenir dans sa ville natale. Il devient instituteur à Gossas, mais continue à se former à la gestion et à la finance. Il fait ensuite une carrière au sein de la compagnie aérienne Air Afrique.
Dans la foulée, Youssou Diagne est nommé ambassadeur en république de Chine (Taïwan). À son retour il devient Président du Conseil d'administration de l'APIX, l'Agence nationale chargée de la promotion des investissements et des grands travaux.