Cadet d’une famille de cinq enfants dont deux sœurs et deux frères,Youssouf Niakaté commence le foot dans son quartier. Fréquentant déjà le club de sa ville natale Coulommiers, à l'âge de 16 ans il rejoint le FK Banik Most en République Tchèque par le biais d'un ami. Il fait six (6)mois dans ce club[2].
Il intègre par la suite le club de Saint-Maur Lusitanos en DHR où il fait également ses preuves et est recruté par Aubervilliers. Youssouf Niakate s’impose lors de sa deuxième saison avec 10 buts dont 3 doublés et des passes décisives. Au vu de ses exploits, le club Avranches ne tarde pas à l’enrôler en début juin 2014[3]. Il parcourt également d’autres club tels que: Union Saint-Gilloise , Boulogne-sur-Mer et Créteil[4].
Youssouf Niakaté joue actuellement comme attaquant pour le club des Émirats arabes unis Baniyas[5]. Il a été appelé en équipe nationale du Mali pour une série de matchs de qualification pour la Coupe du monde de la FIFA 2026 en novembre 2023[6].