ATRX

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PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号ATRX, ATR2, JMS, MRXHF1, RAD54, RAD54L, SFM1, SHS, XH2, XNP, ZNF-HX, MRX52, alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked, chromatin remodeler, ATRX chromatin remodeler
ATRX
PDBに登録されている構造
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PDBのIDコード一覧

2JM1, 2LBM, 2LD1, 3QL9, 3QLA, 3QLC, 3QLN, 4W5A

識別子
記号ATRX, ATR2, JMS, MRXHF1, RAD54, RAD54L, SFM1, SHS, XH2, XNP, ZNF-HX, MRX52, alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked, chromatin remodeler, ATRX chromatin remodeler
外部IDOMIM: 300032 MGI: 103067 HomoloGene: 416 GeneCards: ATRX
遺伝子の位置 (ヒト)
X染色体
染色体X染色体[1]
X染色体
ATRX遺伝子の位置
ATRX遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点77,504,880 bp[1]
終点77,786,233 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
X染色体 (マウス)
染色体X染色体 (マウス)[2]
X染色体 (マウス)
ATRX遺伝子の位置
ATRX遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点104,841,221 bp[2]
終点104,973,009 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能 DNA結合
ヌクレオチド結合
chromo shadow domain binding
helicase activity
histone binding
金属イオン結合
DNA translocase activity
methylated histone binding
DNA helicase activity
血漿タンパク結合
加水分解酵素活性
ATP binding
クロマチン結合
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
細胞の構成要素 PML body
SWI/SNF superfamily-type complex
pericentric heterochromatin
染色体
ヘテロクロマチン
nuclear chromosome
テロメア
細胞核
核質
核内構造体
生物学的プロセス クロマチンリモデリング
nucleosome assembly
DNA recombination
post-embryonic forelimb morphogenesis
regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism growth
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
positive regulation of nuclear cell cycle DNA replication
Sertoli cell development
transcription, DNA-templated
protein localization to chromosome, telomeric region
cellular response to DNA damage stimulus
positive regulation of telomeric RNA transcription from RNA pol II promoter
positive regulation of telomere maintenance
DNAメチル化
negative regulation of telomeric RNA transcription from RNA pol II promoter
seminiferous tubule development
精子形成
replication fork processing
negative regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion, telomeric
前脳発生
DNA修復
cellular response to hydroxyurea
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
DNA duplex unwinding
regulation of histone H3-K9 trimethylation
meiotic spindle organization
chromosome organization involved in meiotic cell cycle
chromatin organization
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_000489
NM_138270
NM_138271

NM_009530

RefSeq
(タンパク質)

NP_000480
NP_612114

NP_033556

場所
(UCSC)
Chr X: 77.5 – 77.79 MbChr X: 104.84 – 104.97 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

ATRX(alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked)は、ヒトではATRX遺伝子にコードされるタンパク質である[5][6][7]

転写調節因子ATRXはATPアーゼ/ヘリカーゼドメインを持つ、SWI/SNFファミリークロマチンリモデリング因子である。ATRXはテロメアやその他ゲノム上の反復領域へのヒストンバリアントH3.3の蓄積に必要である[8]。その作用は、こうした部位でのサイレンシングの維持に重要である[9][10][11]

ATRXは細胞周期依存的なリン酸化を受け、核マトリックス英語版クロマチンへの結合が調節されている。このことは、ATRXが間期における遺伝子調節や有糸分裂時の染色体分離に関与していることを示唆している[7]

臨床的意義

遺伝性変異

ATRX遺伝子の遺伝性変異は、ATR-X症候群と関係している。こうした変異はDNAメチル化パターンに多様な変化を引き起こすことから、ATRXは発生過程におけるクロマチンリモデリング、DNAメチル化、そして遺伝子発現を関連付けている可能性がある。女性の変異保因者では偏った(skewed)X染色体不活性化がみられる[7]

体細胞変異

ATRXの後天的変異は、膵神経内分泌腫瘍英語版[12]神経膠腫[13][14]骨肉腫[15]、悪性褐色細胞腫[16]など、いくつかのがんで報告されている。がんでは、ATRXの変異とテロメラーゼ非依存的なテロメア伸長(alternative lengthening of telomere、ALT)との強い相関がみられる[12]

相互作用

ATRXは、H3.3に対するシャペロン(ヒストンシャペロン)であるDAXX英語版と複合体を形成する[17]

ATRXはEZH2と相互作用することも示されている[18]

出典

関連文献

関連項目

外部リンク

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