EcoRI

1972年、カリフォルニア大学のハーバート・ボイヤーの研究室で大腸菌から単離された。大腸菌（Escherichia coli）のRY13株から見つかった1番目の制限酵素ということで、「EcoRI」と命名された^[1]。

1986年、制限酵素として初めて結晶構造が報告された^[2]。

EcoRIはIIP型に分類される制限酵素であり、DNA中の　5'-GAATTC-3'　というパリンドロームになっている6塩基配列を認識し、GとAの間に切れ目を入れ、切り口に付着末端を作り出す。この時、酵素との結合部でDNAを直角に屈曲させることが分かっている。なお、大腸菌自身の遺伝子は、この配列の部分がメチル化されているため、切断される心配はない。

EcoRIの切断パターン

 切断前の配列   　　　切断後の配列
 5'-GAATTC-3'    5'-G　AATTC-3'
 3'-CTTAAG-5'    3'-CTTAA　G-5'

• 制限酵素
• ヌクレアーゼ
• EcoRV