PLUMED
From Wikipedia, the free encyclopedia
| 開発元 | Max Bonomi, Giovanni Bussi, Carlo Camilloni, Gareth Tribello |
|---|---|
| 初版 | 2009年 |
| 最新版 |
2.10.0
/ 2025年8月26日 |
| リポジトリ |
github |
| プログラミング 言語 | C++（C、Fortran、Pythonに対するバインディングも利用可能） |
| 対応OS | Linux, macOS |
| 種別 | 分子動力学 |
| ライセンス | GNU LGPL |
| 公式サイト |
www |
PLUMED（PLugin for MolEcular Dynamics、プルームド[1]）は、分子動力学シミュレーションのための拡張サンプリングアルゴリズム、様々な自由エネルギー手法、および解析ツールを実装するオープンソースライブラリである。ACEMD、AMBER、DL_POLY、GROMACS、LAMMPS、NAMD、OpenMM、ABIN、CP2K、i-PI、PINY-MD、およびQuantum ESPRESSOと一緒に使うために設計されているが、解析および可視化ツールのVMD、HTMD、OpenPathSamplingと一緒に使うこともできる[2][3]。
加えて、PLUMEDは分子動力学トラジェクトリの分析のためのスタンドアローンツールとして使うこともできる。METAGUIと名付けられたグラフィカルユーザインタフェースも入手可能である[4]。
"Plumed" は英語で「羽毛のある」の意。
