セクエストソーム-1

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セクエストソーム-1(Sequestosome 1)は、ヒトではSQSTM1遺伝子がコードするタンパク質である[5][6][7]ユビキチン結合タンパク質p62とも呼ばれ[8]、選択的オートファジーのために標的となる他のタンパク質と結合するオートファゴソームのカーゴタンパク質である。GATA4英語版と結合してこれを分解の標的とすると、GATA-4に関連する老化細胞老化随伴分泌現象英語版阻害することができる[9]

PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号SQSTM1, A170, OSIL, PDB3, ZIP3, p60, p62, p62B, FTDALS3, Sequestosome 1, NADGP, DMRV
染色体5番染色体 (ヒト)[1]
概要 SQSTM1, PDBに登録されている構造 ...
SQSTM1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1Q02, 2JY7, 2JY8, 2K0B, 2KNV, 4MJS, 4UF8, 4UF9

識別子
記号SQSTM1, A170, OSIL, PDB3, ZIP3, p60, p62, p62B, FTDALS3, Sequestosome 1, NADGP, DMRV
外部IDOMIM: 601530 MGI: 107931 HomoloGene: 31202 GeneCards: SQSTM1
遺伝子の位置 (ヒト)
5番染色体 (ヒト)
染色体5番染色体 (ヒト)[1]
5番染色体 (ヒト)
SQSTM1遺伝子の位置
SQSTM1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点179,806,398 bp[1]
終点179,838,078 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
11番染色体 (マウス)
染色体11番染色体 (マウス)[2]
11番染色体 (マウス)
SQSTM1遺伝子の位置
SQSTM1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点50,090,193 bp[2]
終点50,101,654 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 protein homodimerization activity
receptor tyrosine kinase binding
zinc ion binding
SH2 domain binding
金属イオン結合
protein serine/threonine kinase activity
K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding
血漿タンパク結合
identical protein binding
プロテインキナーゼ結合
protein kinase C binding
ubiquitin binding
酵素結合
ubiquitin protein ligase binding
ionotropic glutamate receptor binding
細胞の構成要素 細胞質
エンドソーム
PML body
late endosome
Pボディ
phagophore assembly site
核質
アグリソーム
オートファゴソーム
amphisome
小胞体
封入体
リソソーム
sperm midpiece
エキソソーム
cytoplasmic vesicle
細胞核
細胞質基質
細胞内膜で囲まれた細胞小器官
autolysosome
ミトコンドリア
サルコメア
レビー小体
生物学的プロセス アポトーシス
タンパク質局在化
細胞分化
positive regulation of protein phosphorylation
intracellular signal transduction
ubiquitin-dependent protein catabolic process
regulation of mitochondrion organization
protein heterooligomerization
免疫系プロセス
ストレスへの反応
regulation of Ras protein signal transduction
negative regulation of apoptotic process
オートファジー
endosomal transport
regulation of protein complex stability
マイトファジー
positive regulation of apoptotic process
regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
タンパク質リン酸化
mitophagy
response to mitochondrial depolarisation
macroautophagy
endosome organization
protein localization to perinuclear region of cytoplasm
response to ischemia
mitochondrion organization
aggrephagy
selective autophagy
interleukin-1-mediated signaling pathway
positive regulation of long-term synaptic potentiation
positive regulation of protein localization to plasma membrane
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001142298
NM_001142299
NM_003900

NM_001290769
NM_011018

RefSeq
(タンパク質)

NP_001135770
NP_001135771
NP_003891

NP_001277698
NP_035148

場所
(UCSC)
Chr 5: 179.81 – 179.84 MbChr 5: 50.09 – 50.1 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
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モデル生物

SQSTM1遺伝子の機能の研究のためにモデル生物が用いられている。ハイスループット突然変異誘発により病気の動物モデルを作り出し科学者に頒布するプロジェクトである国際ノックアウトマウスコンソーシアム英語版がSqstm1tm1a(KOMP)Wtsi[10][11]と呼ばれるコンディショナルノックアウトマウスの系統を作り出している[12][13][14]

遺伝子欠損の効果を確認するために、規格化された表現型スクリーニングが雄雌の動物に対して行われた[15][16]。22の試験がホモ接合変異マウスに対して行われ、そのうちの1つで重大な異常が観察された。メスは、赤血球分布幅の増加や平均血小板容積の増加等、全血球計算のパラメータが異常値を示した[15]

相互作用

セクエストソーム-1は、以下のタンパク質とタンパク質間相互作用する。

出典

関連文献

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