WD40リピート

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WD domain, G-beta repeat
Ribbon diagram of the C-terminal WD40 domain of Tup1 (a transcriptional corepressor in yeast), which adopts a 7-bladed beta-propeller fold. Ribbon is colored from blue (N-terminus) to red (C-terminus).[1]
識別子
略号 WD40
Pfam PF00400
Pfam clan CL0186
InterPro IPR001680
PROSITE PDOC00574
SCOP 1gp2
SUPERFAMILY 1gp2
CDD cd00200
利用可能な蛋白質構造:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum structure summary
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WD40リピート (WDリピートあるいはβトランスデューシンリピートとしても知られる)は、およそ40アミノ酸の短いモチーフ構造の繰り返しで出来ている。この繰り返しは、多くの場合トリプトファン-アスパラギン酸ペプチド配列(WD)で終わっていることからこの名前がついた。このリピート配列がいくつか繋がって筒状構造をとる。

WD40ドメイン含有タンパク質は、4〜16の反復単位を有し、これらが環状β-プロペラ構造を形成すると考えられている(右図参照)。 WD40ドメインは、いくつかのリピートからなっている。一つのリピートは最初に約20残基の可変領域、次に共通の反復残基のセットで構成されている。これらの反復は、典型的には、4本鎖の逆平行βシートまたはブレードを形成する。これらのブレードが会合することでプロペラを形成し、最も一般的なものは7ブレードのベータプロペラである。ブレードは連動して、1つのリピートの最後のβストランドが次のリピートの最初の3つと形成され、3次元ブレード構造を形成する。

機能

脚注

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