デートリンゲンに牧師の息子に生まれた。ハレ大学で医学を学んだ。エアランゲン大学で医学号を得た後、デートリンゲンで21年間医師として働いた。1779年に、1000人しか住民がおらず、周りの地域にも医師がいないニーダーザクセン州のフェーゲザック（Vegesack）に移った。
1781年に、Landphysikusに任命され、いくつかの医学書を執筆した。フェーゲザックに移住してから、科学書の執筆をはじめ、1788年の植物書、『ドイツ植物相試論』（"Tentamen florae germanicae"）はドイツのすべての植物を分類したもので、ヴィルヘルム・オルバース・フォッケ（Wilhelm Olbers Focke）によって高く評価された。1802年に海藻の調査のために北海やバルト海を調査した。
1787年にヴェーザー河畔に土地を与えられ、庭園を作り上げ、これは後にフェーゲザックの市立庭園になっている。ロートの評判はゲーテの知るところとなり、1803年にイェナ大学から植物学教授、1810年にエアランゲン大学から教授への就任を求められるが断った。1808年にババリア科学アカデミーの会員に選ばれた。
マメ亜科の属名、Rothiaに献名されている。
