サイクロバクター属
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| サイクロバクター属 | ||||||||||||||||||
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| 分類 | ||||||||||||||||||
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| 学名 | ||||||||||||||||||
| Psychrobacter Juni and Heym 1986[1] | ||||||||||||||||||
| タイプ種 | ||||||||||||||||||
| サイクロバクター・インモビリス Psychrobacter immobilis Juni and Heym 1986[1] | ||||||||||||||||||
| 下位分類（種） | ||||||||||||||||||
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本文を参照 |
サイクロバクター属（Psychrobacter）はシュードモナス目モラクセラ科の属の一つであり、グラム陰性、高浸透圧耐性、オキシダーゼ陽性、高齢性であり性、好気性の真正細菌である[2][3][4][5]。形状は、典型的には球菌または球桿菌[6]。この属の菌種のいくつかは人間から分離され、心内膜炎や腹膜炎などの人間に対する感染症を引き起こす可能性が知られている[7]。この細菌は好冷性であり、-10〜42 °Cの温度で増殖できる[8]。この属の細菌が最初に発見されたのは1986年のことであり[1]、その種はPsychrobacter immobilisであったが、2002年になりDNA-rRNAハイブリダイゼーション分析によりサイクロバクター属がモラクセラ科に属することが決定された[9]。サイクロバクター属細菌は、高湿度、低温の高塩分濃度の環境[10]、並びに、温暖で低塩分濃度の環境と広範囲で生育する[11]。
Psychrobacter cryohalolentisおよびPsychrobacter arcticusから単離された低アシル化リポ多糖（LPS: Hypoacylated lipopolysaccharide）は、マクロファージにおいて中程度のTLR4媒介性炎症反応を誘発し、これにより、これら最近の感染症患者は局所および全身の細菌排除機構の不全をもたらす可能性がある[12]。
IJSEMに正式承認されている種
サイクロバクター属は以下の種を含む(2024年8月現在)[2]。
- Jung et al. 2005
- Kämpfer et al. 2015
- Shang et al. 2022
- Pallen 2024
- Kämpfer et al. 2002
- Zeng et al. 2022
- Bozal et al. 2003
- Bowman et al. 1996
- Psychrobacter fulvigenes サイクロバクター・フルビゲネス
- Romanenko et al. 2009
- Psychrobacter glaciei サイクロバクター・グラキエイ
- Zeng et al. 2016
- Psychrobacter glacincola サイクロバクター・グラシンコーラ
- Bowman et al. 1997
- Shang et al. 2022
- Juni and Heym 1986[1]
- Psychrobacter jeotgali サイクロバクター・ジェオトガリ
- Yoon et al. 2003
- Psychrobacter luti サイクロバクター・ルティ
- Bozalet al. 2003
- Psychrobacter lutiphocae サイクロバクター・ルチフォカエ
- Yassin and Busse 2009
- Psychrobacter marincola サイクロバクター・マリンコーラ
- Romanenko et al. 2002
- Psychrobacter maritimus サイクロバクター・マリティムス
- Psychrobacter namhaensis サイクロバクター・ナムハエンシス
- Psychrobacter nivimaris サイクロバクター・ニビマリス
- Heuchert et al. 2004
- Psychrobacter oceani サイクロバクター・オセアニ
- Matsuyama et al. 2015
- Psychrobacter okhotskensis サイクロバクター・オホーツケンシス
- Yumoto et al. 2003
- Psychrobacter pacificensis サイクロバクター・パシフィセンシス
- Maruyama et al. 2000
- Psychrobacter pasteurii サイクロバクター・パステウリイ
- Hurtado-Ortiz et al. 2017
- Psychrobacter phenylpyruvicus サイクロバクター・フェニルピルビクス
- (Bøvre and Henriksen 1967) Bowman et al. 1996
- Psychrobacter piechaudii サイクロバクター・ピエシャウディイ
- Hurtado-Ortiz et al. 2017
- Psychrobacter piscatorii サイクロバクター・ピスカトリイ
- Yumoto et al. 2010
- Psychrobacter pocilloporae サイクロバクター・ポシロポラエ
- Zachariah et al. 2016
- Psychrobacter proteolyticus サイクロバクター・プロテオリチクス
- Denner et al. 2001
- Psychrobacter pulmonis サイクロバクター・プルモニス
- Vela et al. 2003
- Psychrobacter pygoscelis サイクロバクター・ピゴスセリス
- Kämpfer et al. 2020
- Manzulli et al. 2024
- Psychrobacter salsus サイクロバクター・サルサス
- Psychrobacter sanguinis サイクロバクター・サングイニス
- Wirth et al. 2012
- Psychrobacter submarinus サイクロバクター・サブモリヌス
- Romanenko et al. 2002
- Psychrobacter urativorans サイクロバクター・ウラティボランス
- Bowman et al. 1996
- Psychrobacter vallis サイクロバクター・バリス
IJSEMに未承認の種
- "Psychrobacter cryopegella"
- Bakermans et al. 2003
- "Psychrobacter muriicola"
- Shcherbakova et al. 2009
- "Psychrobacter psychrophilus"
- Mindlin et al. 2008
- "Psychrobacter communis"
- Gilroy et al. 2021
脚注
[脚注の使い方]
- 1 2 3 4 Elliot Juni, Gloria A. Heym (01 July 1986). “Psychrobacter immobilis gen. nov., sp. nov.: Genospecies Composed of Gram-Negative, Aerobic, Oxidase-Positive Coccobacilli”. International Journal of Systematic Bacteriology 36 (3): 388. doi:10.1099/00207713-36-3-388.
- 1 2 “Genus Psychrobacter”. LPSN. 2021年8月31日閲覧。
- ↑ Maruyama, A.; Honda, D.; Yamamoto, H.; Kitamura, K.; Higashihara, T. (2000). “Phylogenetic analysis of psychrophilic bacteria isolated from the Japan Trench, including a description of the deep-sea species Psychrobacter pacificensis sp. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 50 (2): 835–46. doi:10.1099/00207713-50-2-835. PMID 10758895.
- ↑ Bozal, N. (2003). “Characterization of several Psychrobacter strains isolated from Antarctic environments and description of Psychrobacter luti sp. nov. And Psychrobacter fozii sp. nov”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 (4): 1093–1100. doi:10.1099/ijs.0.02457-0. PMID 12892132.
- ↑ Bowman, J. P. (2006). “The Genus Psychrobacter”. The Prokaryotes. pp. 920–930. doi:10.1007/0-387-30746-X_35. ISBN 978-0-387-25496-8
- ↑ Psychrobacter immobilis isolated from foods: characteristics and identification Vet.
- ↑ Elmer W. Koneman (11 January 2005). Koneman's Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology (6 ed.). Lippencott Williams & Wil. ISBN 0781730147
- ↑ Kim, S. J.; Shin, S. C.; Hong, S. G.; Lee, Y. M.; Choi, I. -G.; Park, H. (2012). “Genome Sequence of a Novel Member of the Genus Psychrobacter Isolated from Antarctic Soil”. Journal of Bacteriology 194 (9): 2403. doi:10.1128/JB.00234-12. PMC 3347060. PMID 22493207. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3347060/.
- ↑ Romanenko, L. A. (2002). “Psychrobacter submarinus sp. nov. And Psychrobacter marincola sp. nov., psychrophilic halophiles from marine environments”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52 (4): 1291–1297. doi:10.1099/ijs.0.02087-0. PMID 12148642.
- ↑ Martin Dworkin; Stanley Falkow; Eugene Rosenberg; Karl-Heinz Schleifer; Erko Stackebrandt (2006-09-28). The Prokaryotes: Proteobacteria: Gamma Subclass: A Handbook on the Biology of Bacteria Vol. 6 (3 ed.). Springer. ISBN 038725496X
- ↑ Koki Horikoshi; Garabed Antranikian; Alan T. Bull; Frank T. Robb; Karl O. Stetter (2011). Extremophiles Handbook Vol. 1. Springer. ISBN 4431538976
- ↑ Korneev, KV; Kondakova, AN; Arbatsky, NP; Novototskaya-Vlasova, KA; Rivkina, EM; Anisimov, AP; Kruglov, AA; Kuprash, DV et al. (December 2014). “Distinct biological activity of lipopolysaccharides with different lipid A acylation status from mutant strains of Yersinia pestis and some members of genus Psychrobacter.”. Biochemistry. Biokhimiia 79 (12): 1333–8. doi:10.1134/S0006297914120062. PMID 25716726.
- 1 2 S Shivaji, G S N Reddy, P U M Raghavan, N B Sarita, Daniel Delille (15 December 2004). “Psychrobacter salsus sp. nov. and Psychrobacter adeliensis sp. nov. isolated from fast ice from Adelie Land, Antarctica”. Systematic and Applied Microbiology 27. doi:10.1078/0723202042369956. PMID 15612619.
- 1 2 “Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology: 547-549. (01 March 2005). doi:10.1099/ijs.0.63680-0.
- ↑ Keun Sik Baik, Seong Chan Park, Chae Hong Lim, Kang Hyun Lee, Doo Young Jeon, Choong Mo Kim, Chi Nam Seong (01 July 2010). “Psychrobacter aestuarii sp. nov., isolated from a tidal flat sediment”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60 (7): 1631–6. doi:10.1099/ijs.0.016782-0. PMID 19717579.
- ↑ “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 60, part 7, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60 (10): 2261-2262. (01 October 2010). doi:10.1099/ijs.0.027870-0.
- ↑ Jung-Hoon Yoon, Soo-Hwan Yeo, Tae-Kwang Oh, Yong-Ha Park (01 January 2005). “Psychrobacter alimentarius sp. nov., isolated from squid jeotgal, a traditional Korean fermented seafood”. International Journal of Systematic and Evolutionary: 171-176. doi:10.1099/ijs.0.63140-0. PMID 15653872.
- ↑ “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 55, part 1, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary: 987-991. (01 May 2005). doi:10.1099/ijs.0.63740-0.
- 1 2 Sisinthy Shivaji, Gundlapalli S. N. Reddy, Korpole Suresh, Pratima Gupta, Suresh Chintalapati, Peter Schumann, Erko Stackebrandt, Genki I. Matsumoto (01 March 2005). “Psychrobacter vallis sp. nov. and Psychrobacter aquaticus sp. nov., from Antarctica”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55: 757-762. doi:10.1099/ijs.0.03030-0. PMID 15774658.
- 1 2 “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 55, part 2, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology: 1399-1402. (01 July 2005). doi:10.1099/ijs.0.63844-0.
- 1 2 Jung-Hoon Yoon, Choong-Hwan Lee, Soo-Hwan Yeo, Tae-Kwang Oh (01 May 2005). “Psychrobacter aquimaris sp. nov. and Psychrobacter namhaensis sp. nov., isolated from sea water of the South Sea in Korea”. International Journal of Systematic and Evolutionary: 1007-1013. doi:10.1099/ijs.0.63464-0. PMID 15879226.
- 1 2 3 “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 55, part 3, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary: 1747-1749. (01 September 2005). doi:10.1099/ijs.0.63918-0.
- 1 2 Corien Bakermans, Héctor L. Ayala-del-Río, Monica A. Ponder, Tatiana Vishnivetskaya, David Gilichinsky, Michael F. Thomashow, James M. Tiedje (01 June 2006). “Psychrobacter cryohalolentis sp. nov. and Psychrobacter arcticus sp. nov., isolated from Siberian permafrost”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56 (6): 1285–1291. doi:10.1099/ijs.0.64043-0. ISSN 1466-5026. PMID 16738105.
- 1 2 “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 56, part 6, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology: 2029-2030. (01 September 2006). doi:10.1099/ijs.0.64630-0.
- 1 2 Lyudmila A. Romanenko, Anatoly M. Lysenko, Manfred Rohde, Valery V. Mikhailov, Erko Stackebrandt (01 September 2004). “Psychrobacter maritimus sp. nov. And Psychrobacter arenosus sp. nov., isolated from coastal sea ice and sediments of the Sea of Japan”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 54 (5): 1741–1745. doi:10.1099/ijs.0.63096-0. PMID 15388738.
- 1 2 “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 54, part 5, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary: 3-5. (01 January 2005). doi:10.1099/ijs.0.63563-0.
- ↑ Jung-Hoon Yoon, Choong-Hwan Lee, So-Jung Kang, Tae-Kwang Oh (01 September 2005). “Psychrobacter celer sp. nov., isolated from sea water of the South Sea in Korea”. International Journal of Systematic and Evolutionary: 1885-1890. doi:10.1099/ijs.0.63682-0. PMID 16166683.
参考文献
- Kim, S. J.; Shin, S. C.; Hong, S. G.; Lee, Y. M.; Choi, I. -G.; Park, H. (2012). “Genome Sequence of a Novel Member of the Genus Psychrobacter Isolated from Antarctic Soil”. Journal of Bacteriology 194 (9): 2403. doi:10.1128/JB.00234-12. PMC 3347060. PMID 22493207. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3347060/.
- Azevedo, J. S. N.; Correia, A. N.; Henriques, I. (2013). “Molecular analysis of the diversity of genusPsychrobacterpresent within a temperate estuary”. FEMS Microbiology Ecology 84 (3): 451–460. doi:10.1111/1574-6941.12075. PMID 23330979.
- Koki Horikoshi; Garabed Antranikian; Alan T. Bull; Frank T. Robb; Karl O. Stetter (2011). Extremophiles Handbook Vol. 1. Springer. ISBN 4431538976
- George Garrity; Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James R. Staley (2005-06-16). Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology: Volume 2: The Proteobacteria, Part B: The Gammaproteobacteria (2 ed.). Springer. ISBN 0387241442
- Isao Yumoto (2013-08-13). Cold-Adapted Microorganisms. Caister Academic Press. ISBN 1908230266
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