ホイットマンは博士論文以来、日本語と朝鮮語の音対応をアクセントを考慮してより厳密に提示した。
Whitman, John (1990), “A Rule of Medial -r- Loss in Pre-Old Japanese ”, in Baldi, Philip , Linguistic Change and Reconstruction Methodology Mouton de Gruyter , pp. 511-545, ISBN 3110119080 またビャーケ・フレレスビッグ とともに日本祖語 の再構に関する書物を編集した。この中で日本祖語の7母音説を唱えたほか、動詞活用の起源についても新説を述べている。
Frellesvig, Bjarke; Whitman, John , ed. (2008), Proto-Japanese: Issues and Prospects John Benjamins , ISBN 9789027248091 ほかに語順などに関する言語類型論 的な研究も行っている。
竹沢幸一; Whitman, John『格と語順と統語構造』研究社出版 〈日英語比較選書 9〉、1998年。ISBN 4327260096 。 高見健一・神尾昭雄・John Whitman, ed. (2000), Syntactic and functional explorations : in honor of Susumu Kuno くろしお出版 , ISBN 4874241972 Yanagida, Yuko ; Whitman, John (2009), “Alignment and Word Order in Old Japanese ” , Journal of East Asian Linguistics 18 (2): 101-144, JSTOR 40345246 , https://www.jstor.org/stable/40345246 Whitman, John; 柳田優子 著「人称と活格類型上代日本語の代名詞体系の観点から」、坪本篤朗・早瀬尚子・和田尚明 編『「内」と「外」の言語学』開拓社、2009年、175-214頁。ISBN 9784758921459 。 Whitman, John (2012), “The relationship between Japanese and Korean ”, in Nicolas Tranter , The Languages of Japan and Korea Routledge , ISBN 0415462878 
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