ピバビスカ湖へは幾つかの河川が流れ込んできている。主要な流入河川は、この湖とほとんど標高の変わらない所に存在するウォルバライン湖(湖面の標高は約235 m)から流出する水を、ピバビスカ湖の西岸へと流れ込ませているバレンタイン川(Valentine River)である。なお、バレンタイン川は、その流路の途中に幾つも湖が存在する川だが、ピバビスカ湖に流れ込んだところで、バレンタイン川は終わっている。この他に、ピバビスカ湖の東岸へと流れ込んでいるピバビスカ小河川群(Pivabiska Narrows)もある。これに対して、ピバビスカ湖から流出している主要な河川はピバビスカ川のみである。したがって、この湖から流れ出した水は、最終的にムース川の河口から、北極海の一部であるジェームズ湾へと流れ込む。