旧来の地方区分でマルマリカ、イタリア領リビアのもとではキレナイカ州の一部だった現在のブトナーン県の領域は、1963年の十県制でデルナ県(ムハファザー)に組み込まれた。1983年にデルナ県が廃止され、いくつもの新しい県(バラディヤート)が誕生すると、その領域はトブルク県などに分かれた。ブトナーン県は1988年、当時の25県のひとつとして設置された。1995年には新生13県(シャービヤー)のひとつとされ[1]、1998年、2001年、2007年の行政区画再編でも存続し続けてきた。
2007年には、当時自治市だったジャグブーブを編入した。