ムターゼによる分子内転移では、基質の構造は変わるが原子組成は変化しない[1]。「転位反応を触媒する」と表現されることがあるが，転位反応では基質の炭素骨格の変化を伴うのでこの表現は誤りである．また，転移酵素（トランスフェラーゼ）は分子間転移反応，つまり炭素骨格の変化を伴わない基質間の官能基移動反応を触媒するため，ムターゼとトランスフェラーゼは区別される．
この酵素の例として、赤血球中に見られるビスホスホグリセリン酸ムターゼや3-ホスホグリセリン酸を2-ホスホグリセリン酸に変化させて解糖系で働くホスホグリセリン酸ムターゼなどがある[2]。
