当寺は元来、天台宗の寺院で、寺号は「三津寺」と号し、永仁年間(1293-1298)に大智和尚によって開かれたと伝わる。
後世、佐賀藩祖鍋島直茂、初代藩主鍋島勝茂父子が、関ヶ原の戦いで西軍に与し、改易の危機に瀕していたが、小城郡晴気の出身で、徳川家康の側近として仕えていた高僧三要元佶(足利学校第9代庠主、円光寺住職)の尽力で、罪を赦された。直茂・勝茂父子は、三要元佶の尽力に感謝し、慶長年間(1596-1614)に、三津寺を臨済宗に改宗させ、寺領120石を添えて寄進した。寺は、医王山三岳寺と改称し、現在に至っている。