福岡生まれ。群馬県に住む。「音楽教育の会」の研究者・指導者として活動。「子どもたちに本物の音楽を伝えたい」との思いより多数の歌を作曲し、埼玉県、群馬県をはじめ、全国の学校、保育園などで音楽教育の指導を行う。大阪府茨木市にある、茨木市立平田中学校の校歌を制作。
詩人でフランス文学者の大島博光と交流があり、博光の詩「春がきたら」や訳詩「ぼくはパルファン川の歌声を聞く」などを題材にした曲は、多くの子供たちに親しまれている。大島博光記念館に2009年10月に来館、「丸山亜季先生を囲む詩と歌の集い」を開催し講演を行った。なお当記念館には丸山の薦めによる多くの保育園関係の見学がある[2]。