本校は1948年(昭和23年)に函館市が「函館市立青柳中学校」として設置開校[1]。1950年(昭和25年)に「函館市立谷地頭中学校」と改称したあと、1955年(昭和30年)に現在の校名に変更した[1]。
本校では開校記念日を4月12日に指定していた[2]。
また本校は吹奏楽部の活動が有名で、函館地区ではトップクラスの実力を誇り[3]、北海道大会でも上位入賞を度々果たすなど強豪校としてもその名を知られていた[4]。
函館市内小中学校再編計画により、函館市立西中学校、函館市立潮見中学校、函館市立宇賀の浦中学校の3校を統合し函館市立青柳中学校を新設、本校は2018年3月31日を以て閉校となった[5]。