揖斐郡大和村(現・揖斐郡揖斐川町上南方、極楽寺、房島、若松)の産土神社である。また、揖斐郡大和村の名称の由来となる神社である。
創建時期は不詳。美濃国神名帳の「従五位下大和大明神」に該当する[1]。
平安時代にこの地域が藤原氏の荘園となると、春日神を祀り、春日大明神と呼ばれるようになる[1]。
1873年(明治6年)に大和神社に改称する[1]。
1908年(明治41年)、八幡神社、神明神社、稲荷神社を合祀する[1]。
2019年(平成31年)3月、境内の古民家を改修し、ゲストハウス宿屋揖斐川を開業[2]。