1903年に那覇市にて藤田正八郎を社長とする沖縄薬品株式会社（当記事の沖縄薬品とは関連性はない）が設立され、沖縄地区で独占販売していた。その後、1907年に南陽医科薬品機械株式会社が設立された。同社は、武田薬品工業の第一特約店となり武田薬品を主体として販売していた。
1940年には戦時体制に入り、物資統制令が出され、南陽医科薬品の社長であった金城保吉を代表取締役とした沖縄県医薬品衛生材料配給統制株式会社が設立。当時、県内にあったし薬品会社は全て吸収統合され、医薬品は全て同社により統制下におかれることとなる。
1945年6月23日に沖縄戦は終了し、沖縄は米軍の占領下に置かれた。それと同時に、沖縄県医薬品衛生材料配給統制株式会社は事実上消滅し、医薬品等の管理は全て琉球列島米国軍政府（後の琉球列島米国民政府）管轄のメディカルサプライを行うこととなった。
その後、1951年4月30日より医師・歯科医師の自由開業が許されるようになり、また医薬品も日本本土から自由に輸入できるようになったため、メディカルサプライは廃止され、手持ちの医薬品は各民間の薬品会社に払い下げられることとなった。すでに1951年2月には12社（我喜屋本店・楠見薬局・宇治原本店・富原薬店・名城薬局・川田厚生堂・神谷薬局・長嶺薬店・宇治原支店・成田薬房・楠見薬店・我喜屋良栄薬房）の協同購入会社として資本金650万で琉球薬品（那覇市安里1区2班）が設立されていた。また同年4月に後の沖縄薬品株式会社となる沖縄薬品貿易株式会社が設立された。光南薬品、沖縄エイザイ（後のスズケン沖縄。現在はスズケン沖縄薬品。以下同じ）、オリオン薬品（後のオリオン九宏）、南陽薬品が設立された。
日本復帰前、沖縄においては1つのメーカーに対し1つの代理店という一メーカー・一代理店制度をとっており、琉球薬品は中外系、那覇薬品は三共系、光南薬品は第一製薬系、沖縄エイザイはエーザイ系、オリオン九宏は田辺系、南陽薬品は武田系、沖縄薬品は塩野義系となっていた。その為、当時の日本本土とは違い、メーカー間の競争はなく一社独占状態であった。復帰後、各メーカーは一メーカー・一代理店制度を廃止した為に、各会社間で競争が始まり、1975年にオリオン九宏は閉鎖し、主力の田辺は沖縄薬品へ主力を移した。南陽薬品と光南薬品は合併しコーヨー薬品株式会社（現・ダイコー沖縄）となり、沖縄エイザイはスズケンの完全子会社となったことによりスズケン沖縄へと社名変更を行っている。
戦後7社が設立されたが、復帰後の県外企業の資本乗り入れや他者との経営統合などにより現在は3社となっている（但し、これらには復帰後に設立された企業は含まれていない）。なお、3社すべてが県外の医薬品大手卸売会社の子会社となっている。
