小諸藩主牧野康周の庶子として生まれ、明和2年（1765年）元服。明和年間、信濃国伊那郡山吹に所領を持つ旗本・交代寄合の座光寺善兵衛為忠（1115石）の養子となり、座光寺雅楽為高と称す。しかし、明和8年（1771年）に離縁。一説によると養父と不仲となったため、表向きは病と称し、養子の役目ができないとして離縁した。
養子離縁後は、康那と名を改めて、江戸に定府せずに、在所の小諸で食録100俵を与えられ、しばらく無役でいたが、実兄の小諸藩主牧野康満によって、安永7年（1778年）に牧野家の目代に指名される。
甥となる小諸藩主・牧野康陛がが死去し、その嫡子・牧野康儔が21歳で藩主に就任すると、若輩のため不安があったので引き続き目代を勤めたが、寛政6年（1794年）、家臣取り扱いとなり臣籍に降下して、家老上席となる。
牧野康那の業績について、特に文献や伝説として残るものはないが、浅間山の天明大噴火と凶作による混乱期に、在所の小諸にあって藩主を補佐したものと考えられる。康那は藩主の代理人として、城代家老の牧野八郎左衛門を初めとする在所・小諸の伝統的な勢力を抑える役割を果たしたものと推察される。やがて康那が家臣として降下し家老職になったことで、家老の家柄の牧野氏1家が藩内に新たに誕生したとみられたが、牧野求馬に100石で家督が認められたに過ぎなかった。
信濃小諸藩主牧野家では、庶子を牧野姓のままで家臣取り扱いとしたことは4例ないし5例があるが、いずれも冷や飯組であった。康那以外の藩主の庶子たちで家臣扱いになり家祖となった者は、50石・給人の家柄として扱われ、大政奉還まで重臣に名を連ねたことはなかったので、門閥勢力から驚異に思われることはなかった。
信濃小諸藩の本藩となる越後長岡藩主牧野家では、藩主の庶子を家臣とすることは家老に養子に出す場合を除き1例もなかったので、これと対照的である。長岡藩士に牧野姓の家臣はあるが、山本氏・松井氏に牧野姓を賜姓したものである。