長野県諏訪市出身[4]。福島県立安積高等学校卒業[4]。
1955年（昭和30年）明治大学商学部卒業[1]。同年郡山市役所に入り、総務部長、保健衛生部長などを歴任する[3]。
1989年（平成元年）の市長選に立候補したが、この時は現職の青木久に敗れた[5]。
※当日有権者数：-人 最終投票率：71.27%（前回比：-pts）
| 候補者名 | 年齢 | 所属党派 | 新旧別 | 得票数 | 得票率 | 推薦・支持 |
|---|
| 青木久 | 66 | - | 現 | 74,053票 | 48.4% | - |
| 藤森英二 | 56 | - | 新 | 73,188票 | 47.8% | - |
| 渡辺昭好 | 48 | - | 新 | 5,851票 | 3.8% | - |
1993年（平成5年）の市長選に社会党、日本新党の推薦を受けて立候補して、自民党前県議の新人を破って初当選する[6][7]。
※当日有権者数：-人 最終投票率：67.55%（前回比：-pts）
| 候補者名 | 年齢 | 所属党派 | 新旧別 | 得票数 | 得票率 | 推薦・支持 |
|---|
| 藤森英二 | 60 | 無所属 | 新 | 88,395票 | 58.4% | 社会・日本新推薦 |
| 柳沼秀雄 | 56 | 無所属 | 新 | 62,911票 | 41.6% | - |
1997年（平成9年）郡山市を東北初の中核市に移行させる[3][4]。
同年の市長選で新人2人を破って再選を果たした[8]。
※当日有権者数：-人 最終投票率：57.75%（前回比：-pts）
| 候補者名 | 年齢 | 所属党派 | 新旧別 | 得票数 | 得票率 | 推薦・支持 |
|---|
| 藤森英二 | 64 | - | 現 | 86,469票 | 63.0% | - |
| 溝井康之 | 56 | - | 新 | 44,302票 | 32.3% | - |
| 森谷稔 | 42 | - | 新 | 6,473票 | 4.7% | - |
2001年（平成13年）長年の懸案だった郡山駅西口再開発事業でビッグアイを建設。
2003年（平成15年）日東紡績郡山第一工場跡地に21世紀記念公園麓山の杜を建設。
2005年（平成17年）4月26日に郡山市長を退任した[9]。そのほか、全国市長会副会長、県市長会長、日本下水道協会副会長、日本土地区画整理協会副会長、全国水防管理団体連合会副会長、全国都市公園整備促進協議会副会長なども歴任[4]。
2010年（平成22年）春の叙勲で旭日小綬章を受賞。
2018年（平成30年）老衰のため郡山市内の特別養護老人ホームで死去、85歳[3]。死没日をもって正五位に叙される[10]。
