フィリピンを舞台とし、ジャピーノ(日比混血)である主人公トシオの冒険と成長を描いている。タイトルにある虹の谷とは、作中でフィリピン・セブ島にあるとされる谷の名で、雨季になると真ん丸い虹が浮かぶという。物語のほとんどはセブ島ガルソボンガ地区で展開する。
トシオが13歳(1998年)、14歳(1999年)、15歳(2000年)と成長していく3部構成をとっている。
- ジャピーノ13歳 1998年5月 - フィリピン・セブ島
- ジャピーノ14歳 1999年5月 - フィリピン・セブ島
- ジャピーノ15歳 2000年5月 - フィリピン・セブ島