1899年（光緒25年）、許崇智は許応騤の紹介により、福建馬尾船政学堂に入学した。その後、許応騤の援助により日本に留学し、成城学校陸軍科で学ぶ。1902年（光緒28年）に陸軍士官学校の第3期歩兵科に入学した。卒業、帰国した頃に許応騤は死去したが、許崇智は福建武備学堂総弁の孫道仁に目をかけられ、同学堂の教習に任命される。まもなく総教習に昇進した。さらに、許崇智は第10鎮第40標統帯に任命され、まもなく同鎮第20協統領に昇進した。
1911年（宣統3年）、福建の中国同盟会支部に許崇智は加入した。同年10月に武昌起義が発生すると、福州でも革命派が11月8日に決起した。この時、許崇智は蜂起軍の前敵総司令となり、2日の戦闘の末に福州を掌握した。福建軍政府が11月11日に成立すると、孫道仁が都督となり、許崇智は福建海陸軍総司令に任命された。その後まもなく、許崇智は福建第1師師長となっている。
1912年（民国元年）1月に中華民国臨時政府が成立すると、福建第1師は民国陸軍第14師に改編され、許崇智がそのまま師長をつとめた。しかし、袁世凱が臨時大総統となると、許崇智を籠絡しようと北京へ召還している。その後、許崇智は日本を一時訪問し、帰国後に上海で孫文と対面する。その際に宋教仁が暗殺されたと知ると、許崇智は怒って袁世凱打倒を目論み福州へ戻った。
1913年（民国2年）7月、二次革命（第二革命）が勃発すると、袁世凱は許崇智に革命派を攻撃させようとしたが、許崇智はこれを拒む。そして許崇智は革命派に呼応し、都督の孫道仁に福建独立を宣言させた。しかし革命派は敗北し、許崇智もまた8月に上海へ逃走して、率いていた陸軍第14師は袁世凱により解散させられてしまった。
その後、許崇智は日本へ亡命する。1914年（民国3年）7月、東京で孫文が中華革命党を組織すると、許崇智はこれに参加して軍務部長となった。それからしばらくは、孫文の命により、南洋で「革命公債」を発行するなどして中華革命党の資金獲得に奔走した。
1915年（民国4年）12月に帰国して、福建で護国戦争（第三革命）に呼応する反袁世凱の蜂起を行う。さらに山東省へ移って、中華革命軍東北軍参謀長兼前敵総指揮となり、青島に総司令部を設置した。民国5年（1916年）5月、東北軍総司令代理となっている。同年6月に袁世凱が死去すると、許崇智は上海に戻り、引き続き中華革命党軍務部長として孫文を補佐した。なおこの頃に、蔣介石と義兄弟の契りを結んだとされる。
1917年（民国6年）9月に、護法戦争を発動した孫文が広州で護法軍政府を樹立すると、許崇智は大元帥府参軍長兼署陸軍総長に任命された。同年12月、援閩粤軍（総司令：陳炯明）が組織されると、許崇智は第2支隊司令に任命された。翌年5月、北京政府支配下の福建省に向けて援閩粤軍は進軍し、許崇智は第2軍軍長に昇進して汀州に駐屯した。1920年（民国9年）8月、陳炯明・許崇智の軍は、孫文と対立する陸栄廷らの駐粤桂軍（広西軍）を駆逐し、桂軍の後ろ盾を得ていた軍政府主席総裁岑春煊を失脚させた。さらに1921年（民国10年）には広西省へ退却した陸栄廷を追撃し、これも撃破した。
1922年（民国11年）6月、陳炯明が孫文と決裂してこれを攻撃すると、許崇智は陳炯明に反撃した。しかし、一部配下の軍が離反したため、敗北して江西省に逃走した。9月初めには態勢を立て直し、許崇智は福建省へ進攻して北京政府側の督軍李厚基を撃破し、省を手中にした。これにより、孫文から東路軍総司令に任命されている。1923年（民国12年）春、許崇智は広東省の陳炯明を攻撃したが、逆撃に遭い、大敗した。
許崇智 (1940年前後)
1924年（民国13年）1月、許崇智は国民党の第1回全国代表大会に出席し、中央監察委員・中央執行委員会軍事部長に選出された。その後、許崇智の軍は建国粤軍に再編され、許崇智は同軍総司令兼第2軍軍長に、蔣介石は第2軍参謀長にそれぞれ任命された。1925年（民国14年）1月、許崇智率いる粤軍と蔣介石率いる黄埔軍官学校学生軍は、東江の陳炯明を攻撃し、3月までに陳炯明の勢力を完全に掃討した。孫文死後の6月、広西軍の劉震寰・雲南軍の楊希閔が反乱すると、許崇智と蔣介石はこれをも殲滅している。
同年7月1日、広州で国民政府が成立すると、許崇智は国民政府常務委員兼軍事部長に就任し、さらに広東省政府主席、同軍事庁長までも兼ねた。8月20日に廖仲愷が暗殺されると、汪兆銘（汪精衛）・許崇智・蔣介石の3人で構成される特別委員会が組織され、これが政治・軍事の全権を握った。しかし9月になると、蔣介石は汪兆銘の支持を取り付けた上で、電撃的に許崇智の側近を逮捕し、その配下の軍を武装解除してしまう。こうして、許崇智は国民党内での指導的地位を喪失したのである。
これ以後の許崇智は、国民党長老としての声望や地位は有したものの、もはや国内の政治・軍事に重大な影響を与える存在ではなかった。国共内戦の後に香港へ移り、「第三路線」を標榜する活動を続けた。
1965年1月25日、心臓病により死去。享年79（満77歳）。
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清広東省広州府番禺県
