MS-FINDER
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MS-FINDER ist eine Software zur Strukturaufklärung mittels Massenspektrometrie auf Basis des .Net-Frameworks. Hierzu werden Summenformeln von Vorläuferionen von hochauflösenden Massenspektrometern, deren Isotopenverhältnis und Produkt-Ionen vorhergesagt. Auf deren Basis werden alle Isomeren aus Metabolomdatenbanken heruntergeladen, die Tandem-Massenspektrometrie Fragmentierung in silico berechnet und anschließend nach einer Rangliste geordnet, bei der Dissoziationsenergien, Massengenauigkeit, Bindungen und Regeln zur Wasserstoff-Umlagerung berücksichtigt werden.[2] Um die Trefferwahrscheinlichkeit zu steigern kann MS-FINDER auch mit größeren Datenbanken aus hypothetischen Strukturen ergänzt werden, etwa aus Stoffwechselwegen auf Basis von KEGG.[3]
| MS-FINDER | |
|---|---|
| |
| Basisdaten | |
| Aktuelle Version | 3.73[1] |
| Betriebssystem | Windows |
| Kategorie | Strukturaufklärung |
Rezeption
Im CASMI-Wettbewerb 2016 konnten MS-FINDER 89 % der Molekülformeln korrekt vorhersagen.[4] Bei der Untersuchung von phenolischen Komponenten in Lebensmittelmatrix konnte sowohl MS-FINDER als auch SIRIUS über 90 % korrekt identifizieren. Eine Vorhersage von Isomeren ist nicht möglich.[5]
Weblinks
- offizielle Website (englisch)