El primer órgano de la iglesia de Quilmes fue adquirido, a un costo de 4000 pesos, por medio de la asesoría del profesor de música Antonio Barrera Picart. Fue inaugurado el 8 de diciembre de 1888 por el párroco Francisco Suárez Salgado. El órgano emplazado en la catedral actualmente fue adquirido en 1913 por el padre Manuel Bruzzone, quien lo financió por medio de sus propios ahorros, mediante préstamos bancarios y con garantías de sus amigos y vecinos de Quilmes. Bruzzone fue párroco de Quilmes desde 1910 hasta 1929, año de su fallecimiento, quedaba un saldo pendiente, que finalmente pagó el terrateniente José Sarriés. El órgano fue encargado a la firma alemana Laukhuff y fue instalado por el organero italiano Francisco Mascia en 1913, es por ello que los nombres de los registros están en italiano.[1][2]
Se han realizado diferentes actividades para recaudar fondos para mantener el instrumento. El músico Ricardo Soulé brindo un concierto a beneficio para recaudar fondos en 2018.[3]
El organista polaco Michał Szostak brindó un concierto en 2022 en el marco de la celebración del Centésimo Aniversario de Relaciones Diplomáticas de Polonia con Argentina, un evento que contó con el apoyo de la Embajada de la República de Polonia en Buenos Aires.[4]