Nació en uno de los pueblos originarios de Chalco, Santa Catarina Ayotzingo, hijo del español Luis de Vetancurt y de Mariana Cabrera.[2] Su familia paterna era originaria de las Islas Canarias y pariente del conquistador de origen francés Jean de Bethencourt, apellido que españolizó.[3]
Después de ser bachiller en letras humanas y filosofía, fue ordenado fraile franciscano en la ciudad de Puebla hacia 1640[2] sitio donde se dedicó a formar novicios de la orden.[2] Fue trasladado posteriormente al Hospital Real de San José de los Naturales, en donde se encontraba el Colegio de San José de los Naturales y la capilla de San José de los Naturales en donde fue vicario. En ese sitio, debido a su dominio de la lengua náhuatl, fue profesor de la misma y de otras disciplinas como la filosofía, teología, asimismo escribió obras eclesiásticas tanto en español como en náhuatl. También dominó el latín.[1]
Dentro de su labor artística destacó como cronista de la Orden Franciscana en la Nueva España, cargo que le fue confirmado por el papa Inocencio XI,[2] escribiendo la obra Teatro Mexicano: descripción breve de los sucesos exemplares, históricos, políticos y religiosos del Nuevo Mundo Occidental de las Indias. Su obra Arte de lengua mexicana fue un manual para el aprendizaje del náhuatl.[4]