Francisco Hernando Díaz Sanmiguel integró en 1953 la primera promoción de soldados bachilleres, de la que también hicieron parte los futuros generales José Nelson Mejía y Jimmy Rubio, con quienes pasó a integrar el curso de oficiales "Antonia Santos", egresado de la Escuela Militar de Cadetes en 1954. Con el grado de Mayor, Díaz Sanmiguel perteneció a la VIII Brigada bajo el mando del general Ricardo Charry Solano. El 14 de diciembre de 1976 asumió como coronel el comando de la Brigada de Institutos Militares, ante la designación del coronel Manuel Jaime Guerrero Paz como subdirector de la Escuela de Las Américas en Panamá.
El 5 de diciembre de 1979, Díaz Sanmiguel recibió el grado de Brigadier General, junto a los coroneles Óscar Botero Restrepo, Heriberto Arias Martínez, Joaquín Gustavo Gómez Villamizar, Luis Enrique Rodríguez Bótiva, Óscar Mario Acero Ávila, Gilberto Franco Vásquez, José Nelson Mejía Henao y Jimmy Rocha Rubio; y destinado como comandante de la VIII Brigada,[1] unidad militar con la que frustró el plan del grupo guerrillero M19 de tomarse en abril de 1981 el aeropuerto de Pereira y bombardear el batallón San Mateo y el edificio de la Gobernación, mediante operaciones militares en Chocó y Risaralda en las que dio de baja a 32 subversivos que habían recibido entrenamiento en La Habana, entre ellos alias "la chiqui" y Elmer Marín Marín. En agosto del mismo año, logró la desarticulación de una banda de 11 secuestradores que operaba en Sevilla y Caicedonia. El 10 de octubre de 1981, el general Díaz desarticuló al grupo subversivo "Regional del Café", con la baja de su comandante Iván Duque y la captura de sus integrantes.[2]
El 29 de enero de 1982, Díaz asumió como comandante de la Brigada de Institutos Militares en reemplazo del general Josué Leal Barrera, cargo en el cual logró la captura de los 16 integrantes del estado mayor de Bogotá de la guerrilla M-19, entre ellos a Hugo Oswaldo Chávez, asesino del lingüista norteamericano Chester Bitterman. El 22 de diciembre de 1982, Díaz logró la identificación y captura de militantes de la Organización Revolucionaria Popular ORP, a la que se atribuyó el secuestro y asesinato de Gloria Lara de Echeverri, directora del Departamento de Acción Comunal del Ministerio de Gobierno. El 13 de enero de 1983, el general Díaz pasó a ser jefe del Departamento 5 del Comando General de las Fuerzas Militares, y fue reemplazado por el general Pedro Nel Molano.
El 12 de diciembre de 1983, recibió del presidente Belisario Betancur el grado de Mayor General, junto a los brigadieres generales Óscar Botero Restrepo, Luis Enrique Rodríguez Bótiva, Gilberto Franco Vásquez y José Nelson Mejía Henao.[3]
Como comandante de la Tercera División,[4] propinó en 1984 contundentes golpes a las Farcy el M19, como la baja de 20 subversivos en la sierra de El Palo en Cauca. En 1985 asumió Díaz como director de la Escuela Superior de Guerra.