Segundo de una familia de once hermanos de los que sólo seis llegaron a la edad adulta, fue hijo de Antonio López y Agnes Menor; su padre, notario de la Gobernación en Valencia, le encaminó desde la infancia a la carrera eclesiástica y utilizó sus influencias para hacerle progresar: a los nueve años recibió la tonsura, y a los 16 marchó junto a su hermano Jerónimo a Bolonia, en cuya universidad estudiaron Teología y Derecho, respectivamente.
Cuatro años después, obtenido el bachillerato, Juan viajó a Roma y se puso bajo la protección del cardenal vicecanciller Rodrigo de Borgia, a cuya sombra fue ascendiendo: en la década de 1480 fue acumulando cargos y beneficios eclesiásticos que su padre y su hermano administraban desde Valencia, y cuando el cardenal fue elegido papa en el cónclave de 1492 le nombró su secretario, datario y obispo de Perugia.
Personaje inseparable del papa y de su máxima confianza, en el consistorio de 1496 fue creado cardenal junto con sus paisanos Juan de Castro, Bartolomé Martí y Juan de Borja, recibiendo el título de Santa María trans Tiberim.
Fue administrador de Oloron y Carcassone en 1497, arzobispo de Capua desde el año siguiente, administrador de Coria y de Collo en 1499, Camarlengo del Colegio Cardenalicio y arcipreste de San Pedro en 1501, y abad in commendam de varios monasterios en Italia.
Fallecido en 1501 con 56 años, con sospechas de haber sido envenenado por César Borgia,[1] fue sepultado en la basílica de San Pedro.[2]
