Fue uno de los jefes del segundo intento de golpe de Estado de Venezuela de 1992.[1] A consecuencia de ello, fue enjuiciado y preso en el Cuartel San Carlos donde estuvo recluido junto a los otros Integrantes de la Rebelión siendo condenado a 27 años y 6 meses de cárcel con cargos por rebelión militar.
Luego de Dos años de reclusión fue liberado por un sobreseimiento de la causa del presidente Rafael Caldera, siendo luego, a solicitud del propio VA Cabrera Aguirre, el último en salir en libertad, luego que fueran liberados todos sus Subalternos. Siendo por ello Cabrera Aguirre el último preso en toda la historia del Cuartel San Carlos puesto que, posteriormente, fue cerrado y convertido en Museo Histórico. El VA Luis Cabrera Aguirre nunca ocupó cargos en la administración pública pues así se lo solicitó al Presidente Chávez. Siendo posteriormente miembro del Estado Mayor Presidencial durante la presidencia de Hugo Chávez.
Sin embargo, fue señalado por Eladio Aponte Aponte, Magistrado del Tribunal Supremo de Justicia y Presidente de la Sala de Casacion Penal quien afirmó haber recibido llamadas para proteger de cargos penales al supuesto responsable Comandante Maggino del traslado de 2 toneladas de cocaína decomisadas en la ciudad de Carora, Venezuela en un cuartel del ejército de Venezuela y alega a la DEA que fue contactado por los pesos pesados del estamento militar en Venezuela y miembros del Cartel de los Soles: el capitán del Ejército Antonio Morales, quien pertenecía al principal anillo de seguridad de Hugo Chávez; el ministro de la Defensa en ese momento, Raúl Isaías Baduel; el almirante Luis Cabrera Aguirre, miembro del Estado Mayor de la Presidencia, y los generales Henry Rangel Silva, gobernador del estado de Trujillo, y Hugo Carvajal, exjefe de la Dirección de ContraInteligencia Militar (DCIM).[2]
