En 1303 era archidiácono del Obispado de Mallorca y fraile de la Orden de los Predicadores, dentro de la cual gozaba de gran reputación. En 1309, el rey Jaime II de Aragón "el Justo", lo llamó a su corte para confiarle una misión diplomática de primera magnitud ante el Papa Clemente V, poder recaudar un diezmo doble sobre los bienes eclesiásticos de la Corona de Aragón;[1] Jaime II de Aragón quería recaudar este doble diezmo para continuar financiando la cruzada contra Granada. La misión diplomática encargada a fray Pedro Marsili y Fortuny Martí no prosperó en absoluto. Aunque el santo padre la ratificó y le concedió indulgencias a todos aquellos que participaban, se negó a conceder el doble diezmo, la negativa del Papa chocó con el empeño irreverente y temerario de fray Pedro Marsili, que acabó siendo suspendido de todas sus funciones religiosas por el maestro general de la orden de los predicadores.
De regreso, fray Pedro Marsili tuvo que salir de la Corona de Aragón y se exilió en Perpiñán, que entonces formaba parte de la Corona de Mallorca. Jaime II intercedió por él varias veces ante el Papa, hasta que le fue levantada la pena de exilio. De retumba en la Corona de Aragón, el rey, le confió una nueva misión diplomática en el mes de julio de 1312, esta vez en la corte de la Corona de Castilla, con su hija Constanza.
