El seminario original se encontraba en el antiguo convento de Dominicos de la ciudad, la actual parroquia de Santo Domingo de Guzmán. Dicha institución fue creada por el obispo Ildefonso Joaquín Infante y Macías, el 21 de septiembre de 1877. El seminario inició sus tareas de formación de los primeros 54 seminaristas.[2]
Posteriormente, con la llegada del obispo Luis Franco Cascón se inició el proyecto de construcción de un nuevo seminario el 12 de octubre de 1964 y celebrándose el acto de bendición y colocación de la primera piedra el 1 de mayo de 1965.[3] Para recaudar fondos para este proyecto se realizaron diversas actividades tanto pastorales como populares, entre estas destaca la peregrinación que el obispo Franco Cascón estableció de las cuatro patronas insulares de la diócesis en un recorrido por todos los pueblos de sus respectivas islas. De este modo se realizaron los traslados de las imágenes de la Virgen de Candelaria por todos los pueblos de la isla de Tenerife, de la Virgen de las Nieves por La Palma, de la Virgen de Guadalupe por los de La Gomera y de la Virgen de los Reyes por la isla de El Hierro, todas ellas por el mismo motivo.[4]
El edificio del Seminario diocesano fue finalmente inaugurado en 1974 por el obispo Luis Franco Cascón. El edificio es actualmente compartido por otras organizaciones y para otras finalidades, tales como: Instituto Superior de Teología de las Islas Canarias, Residencia Universitaria Santo Tomás de Aquino, Colegio y Centro politécnico.
Según cifras oficiales, en el curso 2017-2018 se formaron 16 seminaristas en el Seminario Mayor diocesano.[5]
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