Viroma
Viroma se refiere al conjunto de virus que a menudo se investiga y describe mediante la secuenciación metagenómica de ácidos nucleicos virales que se encuentran asociados con un ecosistema, organismo u holobionte en particular. La palabra se usa con frecuencia para describir los metagenomas virales de escopeta ambientales. Los virus, incluidos los bacteriófagos, se encuentran en todos los entornos, y los estudios del viroma han proporcionado información sobre el ciclo de los nutrientes, desarrollo de la inmunidad, y una fuente importante de genes a través de la conversión lisogénica.
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Viroma se refiere al conjunto de virus[1][2] que a menudo se investiga y describe mediante la secuenciación metagenómica de ácidos nucleicos virales[3] que se encuentran asociados con un ecosistema, organismo u holobionte en particular. La palabra se usa con frecuencia para describir los metagenomas virales de escopeta ambientales. Los virus, incluidos los bacteriófagos, se encuentran en todos los entornos, y los estudios del viroma han proporcionado información sobre el ciclo de los nutrientes,[4][5] desarrollo de la inmunidad,[6] y una fuente importante de genes a través de la conversión lisogénica.[7]
Los primeros estudios exhaustivos de viromas se realizaron mediante secuenciación comunitaria de escopeta,[8] que con frecuencia se denomina metagenómica. En la década de 2000, el laboratorio Rohwer secuenció viromas de agua de mar,[9] sedimentos marinos,[10] heces humanas adultas,[11] heces humanas infantiles,[12] tierra,[13] y sangre.[14] Este grupo también realizó el primer viroma de ARN con colaboradores del Instituto Genómico de Singapur.[15] A partir de estos primeros trabajos, se concluyó que la mayor parte de la diversidad genómica está contenida en el viroma global y que la mayor parte de esta diversidad permanece sin caracterizar.[16] Este punto de vista fue apoyado por el proyecto de secuenciación genómica individual, en particular el fago de mycobacterium.[17]
