Comenzó su carrera como piloto de carreras de motos en 1968 al participar en la carrera del aeródromo de Mainz-Finthen. En la categoría de 50cc, fue dos veces campeón de Alemania en 1977 y 1980.
En 1974, Muller obtuvo la licencia internacional y en 1976 participó en dos pruebas del Mundial (GP de Alemania donde acabó séptimo y el GP de Italia donde sólo quedó 12.º). Los éxitos en estas carreras permitieron a Wolfgang Müller participar en todas las carreras de la temporada 1977. Además coronó su temporada con su primera victoria en el Campeonato Alemán de Velocidad de 50cc[2] en una dramática batalla por el título entre Hagen Klein e Ingo Emmerich.
Su mejor temporada en el Mundial fue en 1978 donde sumó puntos en todas las carreras y quedó cuarto en la general del Mundial de 50cc por detrás de Eugenio Lazzarini, Ricardo Tormo y el francés Aundry Plisson. En el campeonato alemán fue subcampeón de Alemania detrás de Reiner Scheidhauer de Saarbrücken. No pudo repetir estos buenos resultados en 1979 y solo pudo quedar en la posición 16 de la general.
La temporada de 1980 fue su última temporada. Alternó buenos resultados con fallos mecánicos y caídas, acabando en décimo lugar. En el campeonato alemán, tuvo mejor suerte y se proclamó nuevamente campeón nacional en la categoría de 50cc.[3]
A partir de 1981, se hizo cargo de una pequeña empresa de ilustración en su ciudad natal. En 1989 fue socio de una de las primeras start-ups de la región, que se ocupaba del procesamiento digital de imágenes. Una vez jubilado, volvió a participar en carreras de motociclismo amateurs.[4]
