Alphacoronavirus
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Sous-genres de rang inférieur
Alphacoronavirus (ou α-coronavirus, Alpha-CoV) est l'un des quatre genres connus de coronavirus. Il est classé dans la sous-famille des Orthocoronavirinae, la famille des Coronaviridae et l'ordre des Nidovirales. Il regroupe des virus à ARN simple brin enveloppés, de sens positif, d'origine zoonotique.
Dans cette sous-famille, les virus ont des virions sphériques avec des projections de surface en forme de club et une coquille centrale. Le nom vient du latin corona, qui signifie couronne, qui décrit l'apparence des projections vues en microscopie électronique, et qui ressemblent à une couronne solaire. Ce genre contient ce qui était auparavant considéré comme des coronavirus du phylogroupe 1.
Les genres Alphacoronavirus et Betacoronavirus ont des lignées qui descendent du pool génétique des chauves-souris[2].
Les espèces d’Alphacoronavirus infectent principalement les Chauves-souris, mais également d'autres espèces de Mammifères comme l'Homme, le Porc, le Rat, des Mustelidés, des Musaraignes. Les espèces d’Alphacoronavirus humains (HCoV-229E et HCoV-NL63) sont des agents du rhume commun.
