Le , Florencio Villarreal proclama le Plan d'Ayutla avec le soutien des libéraux Juan Álvarez et Ignacio Comonfort. Cet événement déclencha la Révolution d'Ayutla, qui aboutit à la destitution d'Antonio López de Santa Anna, après onze mandats à la présidence du Mexique. Suite à ces événements, le , le nom de la ville est modifié pour inclure la mention «de los Libres» (des Libres)[2].
Le , sous l'administration d'Ignacio Comonfort, Ayutla obtient le statut de ville par décret présidentiel[2].
Le , le centre communautaire Casa de los Saberes (Gúwa Kúma) pour les femmes Mépháá et Tu'un Savi est inauguré à cet endroit comme une forme de réparation communautaire pour le crime (viol) commis par des membres de l'armée mexicaine en contre Inés Fernández Ortega, une militante qui dénonçait les effets de la militarisation sur les communautés, et pour le meurtre de son frère, Lorenzo Fernández Ortega[3].