BioRxiv

Avant la mise en place de bioRxiv, les biologistes étaient divisés sur l'opportunité de la mise en place d'une archive de preprints dédiée. Certains craignaient de se voir « doublés » par leurs compétiteurs et de perdre l'antécédence de leur découverte.

Cependant, certains généticiens avaient déjà pris l'habitude de déposer des manuscrits dans la section « biologie quantitative » de arXiv (lancée en 2003) et n'avaient plus ces préoccupations, puisqu'au contraire ils constataient que les préprints, chronoréférencés, pouvaient appuyer leurs allégations de découverte^[11].

En conséquence de la popularité croissante de bioRxiv, plusieurs revues de biologie ont mis à jour leurs politiques sur des preprints, indiquant qu'ils ne les considèrent plus comme une publication dupliquée comme c'était parfois le cas depuis les années 1960^[12].

L'usage des préprints en biologie est activement promu par le mouvement ASAPBio auprès de tous les maillons de la chaine : institutions, agences de financement et d'évaluation, revues scientifiques, auteurs, etc.

En 2026, une analyse des 13 premières années d'activité de bioRxiv, publiée dans Nature a confirmé l'essor continu du serveur de prépublications dans le domaine des sciences de la vie, où il est devenu un outil central de diffusion rapide des résultats scientifiques. Depuis son lancement en 2013, plus de 310 000 manuscrits y ont été déposés (avec plus de quatre millions de téléchargements mensuels, et environ dix millions de consultations en ligne) : les neurosciences sont la discipline la plus représentée sur le site. Les dépôts mensuels, passés de quelques unités à plus de 4 000 en 2025, sont suivis d’un taux élevé de publication (près de 80 % des prépublications paraissent dans des revues dans les trois ans).
Une vaste enquête faite en 2023 auprès de plus de 7 000 utilisateurs a conclu que la plupart des auteurs publient leurs préprints avant ou au moment de la soumission à une revue, et que 78 % d'entre eux constatent un accroissement de la visibilité de leurs travaux. Le serveur est devenu un lieu de veille stratégique (scientifique et/ou technique) favorisant une culture de rétroaction précoce et ouverte^[13].

Face aux réserves persistantes concernant le manque d'évaluation par les pairs, les risques de mauvaise interprétation par certains lecteurs, et la montée des contenus générés par l’IA générative, bioRxiv a renforcé ses mécanismes de filtrage et développé des formes d’« examen ouvert »^[13].

Selon les retours d'expérience, les effets négatifs perçus restent marginaux, tandis que la plateforme a prouvé la capacité des communautés scientifiques à transformer leurs modes de communication et à expérimenter de nouvelles formes d’ouverture dans la diffusion des connaissances^[13].

Selon Jocelyn Kaiser, du magazine Science, dans sa première année, l'archive a « attiré un flux modeste mais croissant de documents », avec 824 préprints^[14].

En février 2016, le taux de dépôt à bioRxiv a augmenté de façon constante à partir de ~60 ~200 par mois, avec un total de 3 100 documents reçus. Au 21 avril 2017, plus de 10 000 articles avaient été acceptés au total^[15].

En 2017, le nombre mensuel de dépôts a dépassé 810 en mars^[16] et 1 000 en juillet. En mars 2018, ce chiffre a frôlé les 1 500^[17]. En décembre 2019, 2 637 preprints ont été déposés dans bioRxiv^[18]. En 2025, environ 4 000 manuscrits nouveaux y étaient déposés chaque mois^[13].

Début 2020, bioRxiv a joué un rôle important dans la diffusion rapide de la connaissance concernant la pandémie de Covid-19 causée par le coronavirus SARS-CoV-2, en rassemblant sur une même plate-forme dédiée^[19] les preprints déposés dans les archives bioRxiv et medRxiv (mais pas ceux d'autres archives telles que ArXiv). Le premier preprint^[20] a été déposé dans bioRxiv le 19 janvier 2020, moins de trois semaines après la déclaration officielle^[21] des premiers cas par la préfecture de Wuhan, en Chine ; le 31 mars, le millième preprint concernant la Covid-19 via medRxiv apparaissait sur cette plate-forme^[22]. Malgré ce rôle important de diffusion plus rapide d'informations entre experts (capables de porter un regard critique sur les contenus), les preprints n'étant pas formellement validés par des pairs, des voix se sont élevées concernant la fiabilité des informations ainsi postées^[23].

bioRxiv accepte les préprints dans les disciplines suivantes, couvrant toutes les sciences de la vie :

Le lien de bioRxiv vers les revues (bioRxiv to Journals, B2J) permet aux auteurs de soumettre leur manuscrit directement à une revue scientifique à partir de bioRxiv. Les revues qui participent actuellement à B2J sont :