En , Carlyle signe avec les Braves d'Atlanta, qui en font un membre de leur rotation de lanceurs partants en 2007. Le droitier lance dans 22 parties, dont 20 départs. Il remporte huit victoires contre sept défaites et affiche une moyenne de points mérités de 5,21 en 107 manches lancées, son plus haut total en carrière. Le face aux Padres de San Diego, il réalise un exploit peu commun en enregistrant trois retraits sur des prises consécutifs en neuf lancers[4]. Pour la saison 2008, les Braves en font un lanceur de relève à temps plein. Carlyle fait bien en abaissant sa moyenne de points mérités à 3,59 en 45 sorties au monticule et 62 manches et deux tiers lancées. Il gagne de plus ses deux décisions. Il ne joue que 16 parties avec Atlanta en 2009 puis retourne au Japon où il s'aligne avec les Hokkaido Nippon Ham Fighters de la NPB en 2010.
Il rejoint les Mets de New York en février 2014. Lançant dans les majeures pour la première fois depuis 2011, il maintient une moyenne de points mérités d'à peine 1,45 en 31 manches lancées et 6 points accordés (5 mérités) en 27 matchs des Mets en 2014. Le , il signe un nouveau contrat des ligues mineures avec les Mets et est invité à leur prochain camp d'entraînement[5]. Il ne lance que 8 manches en 2015 et quitte New York après y avoir maintenu une moyenne de points mérités de 2,31 en 39 manches, sur deux saisons.
