Capps remporte sa première victoire dans les majeures le dans un gain des Mariners sur les Tigers de Détroit[3]. En 11 parties pour Seattle en 2013, il affiche une moyenne de points mérités de 5,49 et enregistre 66 retraits sur des prises en 59 manches lancées. Il termine l'année avec 3 victoires et autant de défaites.
En 31 manches lancées en 2015, sa seconde saison chez les Marlins, Capps réussit 58 retraits sur des prises pour une moyenne exceptionnelle de 16,8 par 9 manches lancées. Il n'accorde que 5 points dont 4 mérités pour une moyenne de points mérités d'à peine 1,16 en 30 matchs des Marlins.
En , Capps subit une opération Tommy John pour réparer un ligament endommagé dans son coude droit, ce qui doit lui faire rater toute la saison 2016[5].
La motion de Carter Capps est notable pour le bond qu'il effectue durant celle-ci[7]. Après avoir appuyé son pied droit contre la plaque qui se trouve sur le monticule du lanceur, il projette son corps vers l'avant et effectue un bond qui l'amène plus avant sur le monticule, réduisant ainsi la distance entre lui et le frappeur[8] d'environ 30 centimètres[9].
La légitimité de ce style a été questionnée, puisqu'il est plus près du frappeur au moment de décocher son tir. En chez les Zephyrs de La Nouvelle-Orléans, un club mineur, les deux premiers lancers de Capps sont jugés illégaux par l'arbitre et sont par conséquents automatiquement considérés comme des balles[10]. L'entraîneur demande alors à Capps de compléter un but-sur-balles intentionnel avant de le retirer du match et de contacter la MLB afin d'obtenir des précisions sur la légitimité ou non de ce style[10]. La ligue considère «légale» cette façon de faire[11] unique, puisqu'il traîne son pied arrière sur le monticule, restant en contact avec le sol, plutôt que de réellement effectuer un saut[12]. Le lanceur Jordan Walden, qui l'a précédé dans les majeures, présente un style rapellant vaguement celui de Capps, en beaucoup moins prononcé[13].
