Lloyd-Jones commence sa carrière en 1959 en tant que répétiteur à l'Opéra royal de Covent Garden. Il fait ses débuts professionnels de chef d’orchestre en 1961 avec l'Orchestre philharmonique royal de Liverpool. Il a dirigé la «New Opera Company» de 1961 à 1964 et a continué à bâtir sa réputation avec des concerts d'orchestre et de chorale. Il a également participé à des émissions de la BBC et à des productions d'opéras dans des studios de télévision.
En 1972, il a été nommé directeur musical adjoint du Wells Opera Sadler (aujourd'hui English National Opera), où il a mené un vaste répertoire avec notamment la première représentation britannique de Guerre et Paix de Sergueï Prokofiev.
En 1978 Lloyd-Jones a fondé et dirigé l'orchestre de l'Opéra du Nord. Au cours des douze saisons suivantes, il a dirigé plus de cinquante productions à Leeds et dans tout le Nord de l'Angleterre, notamment la première représentation britannique de Jonny spielt auf d'Ernst Křenek et la première britannique de Daphné de Richard Strauss.
En dehors des opéras, il a également dirigé des concerts d'orchestre dans les grandes villes d'Europe, de Scandinavie, de Russie, d' Israël, du Japon, d'Australie et des Amériques et dans des festivals en France et en Allemagne[1],[2].
Pour les enregistrements Lloyd-Jones se spécialise dans la musique britannique et russe, souvent avec Hyperion et Naxos. Ses enregistrements ont inclus le premier enregistrement du Summer's Last Will and Testament (Testament d'été) de Constant Lambert, sorti en 1992 et Tirésias, en 1999[3],[4].
Lloyd-Jones a réalisé un enregistrement du grand opéra d'Arthur SullivanIvanhoe avec Chandos, (2010), nommé pour un Grammy Award[5].