Nietes confirme cette victoire en stoppant au 2d round Eddy Castro le , Erik Ramirez aux points le (après lui avoir fait subir quatre knock down), Manuel Vargas le et Mario Rodriguez le également aux points[2]. Il laisse à son tour son titre vacant en et poursuit sa carrière dans la catégorie supérieure.
Le , il inflige à son compatriote Sammy Gutierrez un KO au 3eround puis il bat Fuentes au 9eround lors de leur second combat le . Nietes conserve ensuite son titre contre Carlos Velarde par abandon à l'issue du 7eround le ; contre Gilberto Parra au 9eround le puis contre Francisco Rodriguez Jr. aux points le et Juan Alejo par décision unanime le .
Le boxeur philippin poursuit sa série de victoires en battant par abandon à l'issue de la 5ereprise Raúl García Hirales lors de leur combat revanche organisé le à Bacolod City. Après 9 défenses victorieuses, il décide le de monter de catégorie de poids et laisse sa ceinture WBO des mi-mouches vacante. Le suivant, Nietes bat aux points l'ancien champion du monde mexicain Edgar Sosa aux points puis remporte le le titre vacant de champion IBF des poids mouches après sa victoire aux points contre Komgrich Nantapech. Il bat ensuite par KO au 7eround Juan Carlos Reveco le puis laisse sa ceinture vacante en afin de poursuivre sa carrière dans la catégorie de poids supérieure.
Donnie Nietes remporte le le titre vacant de champion du monde des poids super-mouchesWBO en s'imposant aux points face au japonais Kazuto Ioka, titre qu'il laisse vacant en . Il est en revanche battu aux points lors du combat revanche le .