Frédéric Béatse exerce la profession de chef d'entreprise et consultant en stratégie Internet. En 2000, il crée l'entreprise de création de sites internet Vidunet. En 2004, celle-ci fusionne avec Inovagora, société de 20 salariés exerçant à Compiègne, et Frédéric Béatse en devient responsable pour la région Ouest.
Il est élu conseiller municipal d'Angers sur la liste du maire Jean Monnier en 1995, réélu lors des élections municipales de 2001 et à nouveau aux élections de 2008. En 2004, il devient adjoint au maire chargé du quartier de la Roseraie[3] De 2010 à 2012, il est adjoint chargé des associations, de la politique de la ville, des quartiers et de l'amélioration du service public. Il est également élu vice-président de la communauté d'agglomération d'Angers Loire Métropole, chargé de la politique de la ville, de la prévention et de la sécurité puis auxquelles s'ajoute ensuite le portefeuille de l'économie sociale et solidaire[4].
En , le maire d'Angers Jean-Claude Antonini présente sa démission[5]. Une élection primaire au sein de la majorité municipale socialiste est organisée pour désigner son successeur: Frédéric Béatse obtient 28 voix, contre 14 pour son adversaire Jean-Luc Rotureau. Frédéric Béatse est élu maire par le conseil municipal le par 38 voix pour, 1 voix contre et 18 votes blancs[6],[7]. La succession rapide des évènements est critiquée par l'opposition: pour la ministre UMPRoselyne Bachelot, il s'agit d'un «mauvais coup fait à la démocratie»[8], tandis que le Mouvement démocrate dénonce une manœuvre électorale[9].
Frédéric Béatse souhaite se présenter à nouveau aux élections municipales de 2014, mais l'adjoint au maire socialiste Jean-Luc Rotureau annonce également son intention de se porter candidat et demande à ce qu'une élection primaire soit organisée pour désigner la tête de liste[10]. Cette proposition n'est pas retenue par les adhérents du Parti socialiste[11], et Jean-Luc Rotureau décide de se mettre en congé du Parti socialiste. Il présente une liste dissidente aux élections municipales[12] et finira en troisième position du scrutin lors du premier tour[13], avant de se retirer sans donner de consigne de vote pour le second tour[14].
Pour les élections régionales de 2015, Frédéric Béatse est choisi pour conduire en binôme avec Stella Dupont, la liste de Christophe Clergeau en Maine-et-Loire[21].
Après avoir présidé durant six ans le groupe d'opposition au conseil municipal, il annonce qu'il ne sera pas tête de liste[22] aux élections municipales de 2020 à Angers mais il figure en dixième position sur la liste Aimer Angers 2020 conduite par la conseillère municipale Silvia Camara-Tombini et l'ex-membre d'Europe Ecologie - Les Verts Stéphane Lefloch[23], mais la liste n'ayant recueilli que 5 sièges, il n'est pas élu.