De 1980 à 1991, il a dirigé le GewandhausChor Leipzig. Dans le même temps, il a enseigné en tant que professeur de direction chorale à la Kirchenmusikschule Halle. En 1982, il a obtenu son diplôme en direction d'orchestre à l'Académie d'été du Mozarteum de Salzbourg. Depuis 1983, il est membre de l'Académie des arts de Berlin. En 1985, il a reçu le Prix d'Osaka Musique. En 1991/1992, il a été professeur de direction chorale à la Hochschule für Musik und Darstellende Kunst Frankfurt am Main et à l'Académie de musique de Detmold.
Il a été nommé maître de chapelle à Leipzig en 1992 et est ainsi le seizième Thomaskantor après Johann Sebastian Bach. Georg Christoph Biller a continué la tradition musicale de ses prédécesseurs dans son travail avec le Thomanerchor. En 1992, il a commencé l'exécution de l'ensemble du cycle des Cantates de Bach dans l'ordre chronologique avec le Thomaschor et l'Orchestre du Gewandhaus. Les cantates sont chantées lors du dimanche approprié de l'année liturgique. En 1994, Georg Christoph Biller a été nommé professeur de direction chorale à la Hochschule für Musik de Leipzig. Depuis 2009, il a enseigné également la direction d'orchestre. Parmi ses étudiants, on trouve le chef d'orchestre Fabian Enders.
En , George Christoph Biller a été nommé Thomaskantor devenant le 16esuccesseur de Bach à ce poste. Le chœur se produit régulièrement trois fois par semaine à l'Église Saint-Thomas, Motet chaque vendredi soir à 6 h et chaque samedi après-midi à 3 h, y compris généralement une cantate de Bach, et le service le dimanche à 9 h.