Gissur Einarsson est lui-même formé à l'école de Skálholt par son prédécesseur Ögmundur Pálsson, qui a une très haute opinion de lui. Il se rend à Hambourg, en Allemagne, pour poursuivre ses études et y découvre la Réforme. En 1538, il retourne en Islande et est ordonné prêtre. Comme plusieurs autres jeunes théologiens, dont Oddur Gottskálksson, traducteur du Nouveau Testament en islandais, il reste un partisan de la Réforme[1].
Ögmundur choisit le jeune théologien comme successeur en 1538, mais impossible de savoir s'il est au courant de son penchant pour la Réforme. Le roi confirme ce choix. Après son retour, Gissur prend possession du siège épiscopal et affiche ouvertement sa conversion au luthéranisme[2]. Ögmundur regrette alors son choix et veut le destituer. Mais Christian III, roi du Danemark, pour qui il s'agit avant tout d'une question de pouvoir, l'en empêche en envoyant des troupes sous le commandement de Christofer Huitfeld en Islande et en faisant venir Ögmundur au Danemark, où il meurt.
À l'automne 1542, Gissur Einarsson est ordonné évêque à Copenhague. Il meurt en 1548, laissant derrière lui son épouse Katrin Eggertsdóttir.