De 1998 à 2001, Lintu a été chef d'orchestre de l'Orchestre philharmonique de Turku. En 1998, il a été directeur artistique du Summer Sounds Festival de l'ensemble finlandais de musique contemporaine Avanti!. Lintu a été chef principal de l'Orchestre philharmonique de Tampere de 2009 à 2013. En , l'Orchestre symphonique de la radio finlandaise a annoncé la nomination de Lintu comme son huitième chef d'orchestre, à compter du , avec un contrat initial de 3 saisons. Il a été chef d'orchestre invité de l'orchestre pour la saison 2012-2013. En , la FRSO a annoncé la prolongation du contrat de Lintu en tant que chef d'orchestre jusqu'en 2021.
En , l'Opéra national de Finlande a annoncé la nomination de Lintu en tant que prochain chef d'orchestre, avec un contrat prenant effet à compter du jusqu'au . Sa direction de l'Opéra national et du Ballet de Finlande a officiellement débuté en . En , l'Orchestre symphonique de Lahti a annoncé la nomination de Lintu en tant que nouveau partenaire artistique, avec un contrat prenant effet à l'automne 2025.
Lintu réside à Helsinki. Il a réalisé des enregistrements pour des labels tels que Claves, Dacapo, Danacord, Hyperion, Naxos et Ondine.
En 2025, Hannu Lintu est nommé directeur musical de l'Orchestre symphonique de Singapour à compter de la rentrée 2026, pour une durée initiale de trois ans[1].
