À partir de 1785, Maurer est membre, conseiller et professeur à l'école élémentaire de dessin de l'Académie de Vienne pendant 32 ans. Maurer fait faire notamment des études systématiques des maîtres de la Haute Renaissance italienne.
Le premier tracé des antiquités par Maurer, avec son style doux, sans contours nets, correspond au goût du baroque tardif, il marque le début du néo-classicisme primitif à l'académie de Vienne.