Le , Quintero frappe son premier coup de circuit dans les grandes ligues, un coup en solo aux dépens de Scott Service des Diamondbacks.
Astros de Houston
Le , les Padres échangent Humberto Quintero aux Astros de Houston contre le lanceur Tim Redding. Le receveur partage son temps entre les majeures et les mineures au cours de ses cinq premières années à Houston avant de jouer l'entière saison 2010 avec les Astros, où il le joueur de confiance de son club à sa position. Il obtient cette année-là 62 coups sûrs et 20 points produits, deux sommets pour une saison depuis son entrée dans les majeures. Ses quatre coups de circuit égalent son total de la saison précédente.
Royals de Kansas City
Le , Quintero et le voltigeurJason Bourgeois passent des Astros aux Royals de Kansas City en retour du lanceur gaucher Kevin Chapman[2]. Quintero frappe pour ,232 avec un circuit et 19 points produits en 43 parties pour Kansas City en 2012. Il est libéré et redevient agent libre le . Le , il rejoint les Marlins de Miami. Sans avoir joué pour Miami, il est libéré le et rejoint les Brewers de Milwaukee le . Il ne joue pas avec Milwaukee et devient joueur autonome après la saison.